Использование разработанных праймеров для детекции фагов группы Р034

Abstract

В работе представлены результаты подбора праймеров для бактерифагов лактококков группы P034. На основании анализа секвенированных последовательностей генома фага BIM BV-37 подобрана структура четырех наборов олигонуклеотидных праймеров, обеспечивающих амплификацию характерных для ДНК фагов группы Р034 фрагментов. ПЦР-анализ коллекционных фагов группы Р034 с разработанными наборами праймеров показал пригодность одной из пар, которая обеспечивает получение ампликонов размером 392 пар нуклеотидов. Продукты амплификации уникальных последовательностей фага BIM BV-37 и родственных ему изолятов отличаются размерами от аналогичных продуктов, образующихся при ПЦР-детекции представителей групп с2, 936 и Р335. Праймеры были использованы для обнаружения фагов в составе сырого молока и молочных продуктах.