Please use this identifier to cite or link to this item: http://elib.belstu.by/handle/123456789/20276
Title: Молекулярно-генетический анализ вирусоподобных элементов в геноме хвойных
Authors: Рубель, Илья Эдуардович
Баранов, Олег Юрьевич
Пантелеев, Станислав Викторович
Разумова, Ольга Александровна
Гущин, Владимир Алексеевич
Макаров, Валентин Владимирович
Keywords: вирусы растений
вирусоподобные генетические элементы
ретротранспозоны
высокопроизводительное секвенирование
молекулярно-генетический анализ
хвойные растения
Issue Date: 2017
Publisher: БГТУ
Citation: Молекулярно-генетический анализ вирусоподобных элементов в геноме хвойных / И. Э. Рубель [и др.] // Труды БГТУ. Сер. 1, Лесное хозяйство, природопользование и переработка возобновляемых ресурсов. - Минск : БГТУ, 2017. - № 1 (192). - С. 39-43.
Description: В статье описывается разнообразие вирусоподобных генетических элементов хвойных. Данные для последующего анализа и поиска вирусоподобных последовательностей в растительном геноме были получены в результате высокопроизводительного секвенирования на основе полупроводниковой детекции протонов (технология Ion Torrent). Приведены общие сведения о схеме секвенирования по этой технологии. В качестве исходного материала использовались геномные и транскриптомные ДНК- и кДНК-библиотеки сосны обыкновенной и ели европейской. Поиск среди полученных протяженных последовательностей проводился путем сопоставления с записями базы данных GenBank (National Center for Biotechnological Information – NCBI), с использованием онлайн-программы BLAST. Был аннотирован ряд последовательностей, имеющих сходство с ранее описанными вирусоподобными генетическими элементами. Среди них – ретротранспозоны групп Ty3/gypsy и Ty1/copia, содержащие длинные концевые повторы (LTR) и широко встречающиеся в геноме ели, а также ретротранспозоны, не содержащие LTR и относящиеся к семейству LINE. При этом все обнаруженные последовательности были уникальными, а большая их часть содержала последовательности различных генов первичного и вторичного метаболизма хвойных, что может косвенно свидетельствовать об их роли в формировании адаптивной изменчивости растений.
URI: http://elib.belstu.by/handle/123456789/20276
Appears in Collections:2017, № 1

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
7Rubel.pdf250.91 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.