Please use this identifier to cite or link to this item:
https://elib.belstu.by/handle/123456789/20276
Title: | Молекулярно-генетический анализ вирусоподобных элементов в геноме хвойных |
Authors: | Рубель, Илья Эдуардович Баранов, Олег Юрьевич Пантелеев, Станислав Викторович Разумова, Ольга Александровна Гущин, Владимир Алексеевич Макаров, Валентин Владимирович |
Keywords: | вирусы растений вирусоподобные генетические элементы ретротранспозоны высокопроизводительное секвенирование молекулярно-генетический анализ хвойные растения |
Issue Date: | 2017 |
Publisher: | БГТУ |
Citation: | Молекулярно-генетический анализ вирусоподобных элементов в геноме хвойных / И. Э. Рубель [и др.] // Труды БГТУ. Сер. 1, Лесное хозяйство, природопользование и переработка возобновляемых ресурсов. - Минск : БГТУ, 2017. - № 1 (192). - С. 39-43. |
Abstract: | В статье описывается разнообразие вирусоподобных генетических элементов хвойных. Данные для последующего анализа и поиска вирусоподобных последовательностей в растительном геноме были получены в результате высокопроизводительного секвенирования на основе полупроводниковой детекции протонов (технология Ion Torrent). Приведены общие сведения о схеме секвенирования по этой технологии. В качестве исходного материала использовались геномные и транскриптомные ДНК- и кДНК-библиотеки сосны обыкновенной и ели европейской. Поиск среди полученных протяженных последовательностей проводился путем сопоставления с записями базы данных GenBank (National Center for Biotechnological Information – NCBI), с использованием онлайн-программы BLAST. Был аннотирован ряд последовательностей, имеющих сходство с ранее описанными вирусоподобными генетическими элементами. Среди них – ретротранспозоны групп Ty3/gypsy и Ty1/copia, содержащие длинные концевые повторы (LTR) и широко встречающиеся в геноме ели, а также ретротранспозоны, не содержащие LTR и относящиеся к семейству LINE. При этом все обнаруженные последовательности были уникальными, а большая их часть содержала последовательности различных генов первичного и вторичного метаболизма хвойных, что может косвенно свидетельствовать об их роли в формировании адаптивной изменчивости растений. |
URI: | https://elib.belstu.by/handle/123456789/20276 |
Appears in Collections: | выпуск журнала постатейно |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
7Rubel.pdf | 250.91 kB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.