Генетическое разнообразие инвазивного аскомицета Hymenoscyphus fraxineus Baral et al. на территории Беларуси

Abstract

С использованием генетических методов исследования (полимеразная цепная реакция, секвенирование по Сэнгеру) проведена верификация чистых культур возбудителя халарового некроза ветвей – аскомицета Hymenoscyphus fraxineus (T. Kowalski) Baral et al., изолированных с усыхающих растений ясеня обыкновенного и ясеня пенсильванского в лесных насаждениях пяти областей республики (Минская, Могилевская, Брестская, Витебская, Гродненская). Видовая идентификация основывалась на секвенировании нуклеотидной структуры региона рибосомной ДНК – 18S рРНК-ВТС1-5,8S рРНК-ВТС2-28S рРНК и ее последующем сравнении с депонентами международного банка генов Национального центра биотехнологической информации (NCBI, США). На основании применения молекулярно-генетического метода RAPD изучена внутривидовая изменчивость 24 штаммов H. fraxineus. В ходе исследования были протестированы 18 RAPD-праймеров. Анализ информативности полученных ДНК-профилей позволил отобрать для изучения внутривидовой изменчивости H. fraxineus 5 праймеров: UBC-268, primer6, UBC-536, Oligo 85 и OPA-09. По результатам RAPD-анализа для исследованных штаммов составлены генетические паспорта по 29 специфическим ДНК-локусам. Установлено, что в исследованной белорусской популяции H. fraxineus отмечается высокий уровень внутривидового разнообразия. Согласно данным RAPD-анализа уровень различий между штаммами в большинстве случаев варьировал в диапазоне 7–47% локусов (DN = 0,0715–0,4769). Данное явление с учетом выявленного диффузного географического распределения генотипов можно объяснить гипотезой проникновения на территорию страны путем многократной инвазии спектра изолятов.