Компьютерное моделирование предполимеризационных комплексов и конкурентных ассоциаций в растворах, образующихся в процессе молекулярного импринтинга три-о-ацетиладенозина

Abstract

В настоящей статье представлены результаты моделирования методом квантовой механики (молекулярной механики) предполимеризационных комплексов, димеров функциональных мономеров и ассоциаций функциональных и сшивающих мономеров, образование которых возможно в процессе получения полимеров с молекулярными отпечатками три-о-ацетиладенозина. В качестве функциональных мономеров рассмотрены метакриловая кислота, метавинилбензойная кислота, в качестве растворителей – бензол и ацетонитрил в соответсвии с экспериментом, проведенным в лаборатории Фесалийского медицинского университета. На основании полученных результатов сделаны выводы о наличии в процессе молекулярного импринтинга конкурентных процессов, препятствующих увеличению количества присоединенных к темплату функциональных мономеров и проявляющихся в большей степени при использовании в качестве функционального мономера метакриловой кислоты. Показано, что в случае ассоциации три-о-ацетиладенозина с тремя мономерами метавинилбензойной кислоты форма связывающей полости может не соответсвовать конфигурации, оптимальной для связывания ингибиторов протеинкиназы.