Разработка и оценка эффективности праймеров для диагностики бактериальных инфекций лесных древесных пород Беларуси методом ПЦР

Abstract

В ходе проведенного исследования были разработаны специфические праймеры для идентификации 20 видов из 12 родов фитопатогенных бактерий, ассоциированных с инфекционными заболеваниями семи лесообразующих пород Беларуси (сосна, ель, дуб, береза, ольха, ясень, осина). Проведены исследования in vitro по изучению эффективности диагностики маркерных локусов rpoB, tuf и coI с использованием чистых культур бактерий, инфицированных и здоровых растительных тканей древесных пород. Результаты показали, что из трех пар разработанных олигонуклеотидов (bacRPOb, bacCOI, bacTUF) одна пара (bacTUF) оказалась подходящей для выявления фитобактерий в растительных образцах. В ходе ПЦР с праймерами bacTUF отмечалась положительная амплификация бактериальной ДНК в образцах чистых культур и инфицированных растительных тканях. При этом кросс-амплификация с растительной ДНК не наблюдалась.